Dr. Öğr. Üyesi Andrew John Harvey
Dr. Öğr. Üyesi Andrew John Harvey
andrew.harvey@yeditepe.edu.trMühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi
Çalışma Alanları: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı , Moleküler Biyoloji ve Genetik , Biyoteknoloji , Enzim ve Mikrobiyal Biyoteknoloji , Moleküler Biyoloji
ORCID: 0000-0002-3488-0531
Akademik Görevler
-
2009
YARDIMCI DOÇENTYEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ
YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ MÜHENDİSLİK-MİMARLIK FAKÜLTESİ GENETİK VE BİYOMÜHENDİSLİK BÖLÜMÜ
Öğrenim Bilgisi
-
1993-2000
DoktoraUniversity of Adelaide
Plant Science
Tez adı: Isolation, Characterization and Differential Expression of Barley b-Glucan Exohyrolase Genes
-
1987-1992
LisansLaTrobe University
Biochemistry
Kitaplar
-
REPROGRAMMING THE GENOME: CRISPR-CAS-BASED HUMAN DISEASE THERAPY
Uslu Merve, Siyah Pinar, HARVEY ANDREW JOHN, KOCABAŞ FATİH, Yayın Yeri: ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE, Sayfa Sayısı: 390, ISBN: 1877-1173
2021 Bilimsel Kitap
Makaleler
-
Enzymatic characterization of ancestral/group\u2010IV clade xyloglucan endotransglycosylase/hydrolase enzymes reveals broad substrate specificities
Seven Merve, Derman Ümit Cem, HARVEY ANDREW JOHN, Yayın Yeri: The Plant Journal, 2021
Uluslararası Hakemli SCI-Expanded Özgün Makale -
In silico analysis of XTH gene family from barley (Hordeum vulgare L.) and their comparative expression analysis during germination
AKDEMİR KOÇ HÜLYA, Seven Merve, Derman Ümit Cem, HARVEY ANDREW JOHN, Yayın Yeri: TURKISH JOURNAL OF BOTANY, 2021
Uluslararası Hakemli SCI-Expanded Özgün Makale -
The Effect of Various Carbon Nanotubes on Barley Germination
AKDEMİR KOÇ HÜLYA,seven merve,kalay şaban,çulha mustafa,HARVEY ANDREW JOHN, Yayın Yeri: Experimed, 2019
Uluslararası Hakemli CAS database Özgün Makale -
Evolutionary Dynamics of the Cellulose Synthase GeneSuperfamily in Grasses
Schwerdt Julian G,MacKenzie Katrin,Wright Frank,Oehme Daniel,Wagner John M,HARVEY ANDREW JOHN,Shirley Neil J,Burton Rachel A,Schreiber Miriam,Halpin Claire,Zimmer Jochen,Marshall David F,Waugh Robbie,Fincher Geoffrey B, Yayın Yeri: PLANT PHYSIOLOGY, 2015
Uluslararası Hakemli SCI-Expanded Özgün Makale -
Heterologous expression of diverse barley XTH genes in the yeast Pichia pastoris
HARVEY ANDREW JOHN, Kaewthai Nomchit, Hrmova Maria, Brumer Harry, Ezcurra Ines, Teeri Tuula T., Fincher Geoff B., Yayın Yeri: Plant Biotechnology, 2010
Uluslararası Hakemli SCI-Expanded Özgün Makale -
Heterologous expression of diverse barley XTH genes in the yeast Pichia pastoris
Harvey AJ, Kaewthai N, Hrmova M, Brumer H, Ezcurra I, Teeri TT, and Fincher GB., Yayın Yeri: Plant Biotechnology, 2010
Uluslararası Hakemli SCI-Expanded Özgün Makale -
A Customized Gene Expression Microarray Reveals that the Brittle Stem Phenotype fs2 of Barley has a Retroelement in the HvCesA4 Cellulose Synthase Gene
Burton RA, Ma G, Baumann U, Harvey AJ, Shirley NJ, Taylor J, Pettolino F, Bacic A, Beatty M, Simmons CR, Dhugga KS, Rafalski JA, Tingey SV, and Fincher GB., Yayın Yeri: PLANT PHYSIOLOGY, 2010
Uluslararası Hakemli SCI-Expanded Özgün Makale -
Substrate specificity and catalytic mechanism of a xyloglucan xyloglucosyl transferase HvXET6 from barley Hordeum vulgare L
Hrmova M, Farkas V, Harvey AJ, Lahnstein J, Wischmann B, Kaewthai N, Ezcurra I, Teeri TT, and Fincher GB, Yayın Yeri: FEBS Journal, 2009
Uluslararası Hakemli SCI-Expanded Özgün Makale -
Rice family GH1 glycoside hydrolases with beta D glucosidase and beta D mannosidase activities
Kuntothom T, Luang S, Harvey AJ, Fincher GB, Opassiri R, Hrmova M, and Cairns JK., Yayın Yeri: ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, 2009
Uluslararası Hakemli SCI-Expanded Özgün Makale -
The genetics and transcriptional profiles of the cellulose synthase like HvCslF gene family in barley Hordeum vulgare L
Burton RA, Jobling SA, Harvey AJ, Shirley NJ, Mather DE, Bacic A, and Fincher GB., Yayın Yeri: PLANT PHYSIOLOGY, 2008
Uluslararası Hakemli SCI-Expanded Özgün Makale -
Cellulose Synthase like CslF Genes Mediate the Synthesis of Cell Wall 1 3 1 4 D Glucans
Burton RA, Wilson SM, Hrmova M, Harvey AJ, Shirley NJ, Medhurst A, Stone BA, Newbigin EJ, Bacic A, and Fincher GB., Yayın Yeri: SCIENCE, 2006
Uluslararası Hakemli SCI-Expanded Özgün Makale -
Molecular modeling of family GH16 glycoside hydrolases Potential roles for xyloglucan transglucosylases hydrolases in cell wall modification in the poaceae
Strohmeier M, Hrmova M, Fischer M, Harvey AJ, Fincher GB, Pleiss J., Yayın Yeri: PROTEIN SCIENCE, 2004
Uluslararası Hakemli SCI-Expanded Özgün Makale -
The CesA gene family of barley Quantitative analysis of transcripts reveals two groups of co expressed genes
Burton RA, Shirley NJ, King BJ, Harvey AJ, Fincher GB., Yayın Yeri: PLANT PHYSIOLOGY, 2004
Uluslararası Hakemli SCI-Expanded Özgün Makale -
Biochemical evidence linking a putative callose synthase gene with 1 3 beta D glucan biosynthesis in barley
Li J, Burton RA, Harvey AJ, Hrmova M, Wardak AZ, Stone BA, Fincher GB., Yayın Yeri: PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 2003
Uluslararası Hakemli SCI-Expanded Özgün Makale -
Regulation of genes encoding beta D glucan glucohydrolases in barley Hordeum vulgare
Harvey AJ, Hrmova M, Fincher GB., Yayın Yeri: PHYSIOLOGIA PLANTARUM, 2001
Uluslararası Hakemli SCI-Expanded Özgün Makale -
Comparative modeling of the three dimensional structures of family 3 glycoside hydrolases
Harvey AJ, Hrmova M, De Gori R, Varghese JN, Fincher GB., Yayın Yeri: PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, 2000
Uluslararası Hakemli SCI-Expanded Özgün Makale -
Purification characterization and determination of primary structure from a cDNA clone
Hrmova M, Harvey AJ, Wang J, Shirley NJ, Jones GP, Stone BA, Hoj PB, FincherGB, Yayın Yeri: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 1996
Uluslararası Hakemli SCI-Expanded Özgün Makale -
Heterologous expression of cDNAs encoding barley Hordeum vulgare 1 3 beta glucanase isoenzyme GV
Xu P, Harvey AJ, Fincher GB., Yayın Yeri: FEBS LETTERS, 1994
Uluslararası Hakemli SCI-Expanded Özgün Makale
Projeler
-
Daha İyileştirilmiş Bir Hücre Duvarına Doğru: Çeşitli Kaynaklardan Heterolog Olarak İfade Edilmiş Xyloglucan Transferase Enzimlerinin Analizi
-Tübitak 1001 Tamamlandı 01.05.2011-01.08.2013 , 198.541 TÜRK LİRASIProjedeki Görev: Yürütücü
-
Ksiloglukan Üzerinde Aktif Olan Atasal Enzimlerin Analizi
-Tübitak 1001 Tamamlandı 15.10.2014-15.01.2017 , 280.630 TÜRK LİRASIProjedeki Görev: Yürütücü
-
Bitkilerde Abiyotik Strese Karşı Koruma Sağlayan Xyloglucan Endotransglycosylase Genlerinin Araştırılması
-Tübitak 1001 Tamamlandı 01.04.2014-01.01.2017 , 336.394 TÜRK LİRASIProjedeki Görev: Yürütücü
-
Viral OTU-benzeri yeni parazit proteinlerinin karakterizasyonu
-Tübitak 1001 Tamamlandı 15.04.2017-15.10.2019 , 420300 TÜRK LİRASIProjedeki Görev: Danışman
Dersler
| Dönem | Ders Adı | Dili | Saat |
|---|---|---|---|
| 2021-2022 | BIOCHEMISTRY I | İngilizce | 6 |
| 2021-2022 | INTRO. TO ORG.CHEM. & BİOMACROMOLECULES | İngilizce | 4 |
| 2020-2021 | BIOCHEMISTRY I | İngilizce | 6 |
| 2020-2021 | INTRO. TO ORG.CHEM. & BİOMACROMOLECULES | İngilizce | 4 |
| 2019-2020 | BIOCHEMISTRY I | İngilizce | 6 |
| 2019-2020 | Techniques in Genetic Engineering II | İngilizce | 6 |
| 2019-2020 | Techniques in Genetic Engineering I | İngilizce | 4 |
| 2019-2020 | INTRO. TO ORG.CHEM. & BİOMACROMOLECULES | İngilizce | 4 |
| 2018-2019 | Techniques in Genetic Engineering II | İngilizce | 6 |
| 2018-2019 | Techniques in Genetic Engineering I | İngilizce | 4 |
| 2018-2019 | INTRO. TO ORG.CHEM. & BİOMACROMOLECULES | İngilizce | 4 |
| 2017-2018 | Techniques in Genetic Engineering II | İngilizce | 6 |
| 2017-2018 | Techniques in Genetic Engineering I | İngilizce | 4 |
| 2017-2018 | INTRO. TO ORG.CHEM. & BİOMACROMOLECULES | İngilizce | 4 |
| 2016-2017 | Techniques in Genetic Engineering II | İngilizce | 6 |
| 2016-2017 | Techniques in Genetic Engineering I | İngilizce | 4 |
| 2016-2017 | INTRO. TO ORG.CHEM. & BİOMACROMOLECULES | İngilizce | 4 |
| 2015-2016 | Techniques in Genetic Engineering II | İngilizce | 6 |
| 2015-2016 | Techniques in Genetic Engineering I | İngilizce | 4 |
| 2015-2016 | INTRO. TO ORG.CHEM. & BİOMACROMOLECULES | İngilizce | 4 |
| 2014-2015 | Techniques in Genetic Engineering II | İngilizce | 6 |
| 2014-2015 | Techniques in Genetic Engineering I | İngilizce | 4 |
| 2014-2015 | INTRO. TO ORG.CHEM. & BİOMACROMOLECULES | İngilizce | 4 |
| 2013-2014 | Plant Genetics | İngilizce | 3 |
| 2013-2014 | INTRO. TO ORG.CHEM. & BİOMACROMOLECULES | İngilizce | 4 |
| 2013-2014 | BİOLOGY II | İngilizce | 3 |
| 2013-2014 | BİOLOGY I | İngilizce | 6 |
| 2012-2013 | Plant Genetics | İngilizce | 3 |
| 2012-2013 | INTRO. TO ORG.CHEM. & BİOMACROMOLECULES | İngilizce | 4 |
| 2012-2013 | BİOLOGY II | İngilizce | 3 |
| 2012-2013 | BİOLOGY I | İngilizce | 6 |
| 2011-2012 | INTRO. TO ORG.CHEM. & BİOMACROMOLECULES | İngilizce | 4 |
| 2011-2012 | BİOLOGY II | İngilizce | 3 |
| 2011-2012 | BİOLOGY I | İngilizce | 6 |
| 2010-2011 | INTRO. TO ORG.CHEM. & BİOMACROMOLECULES | İngilizce | 4 |
| 2010-2011 | BİOLOGY II | İngilizce | 3 |
| 2010-2011 | BİOLOGY I | İngilizce | 6 |
| 2009-2010 | INTRO. TO ORG.CHEM. & BİOMACROMOLECULES | İngilizce | 4 |
| 2009-2010 | BİOLOGY II | İngilizce | 3 |
| 2009-2010 | BİOLOGY I | İngilizce | 6 |
| 2008-2009 | BİOLOGY II | İngilizce | 3 |
| 2008-2009 | BİOLOGY I | İngilizce | 6 |
| Dönem | Ders Adı | Dili | Saat |
|---|---|---|---|
| 2021-2022 | Plant Biotechnology | İngilizce | 3 |
| 2021-2022 | Basic Biotechnology | İngilizce | 3 |
| 2020-2021 | Plant Biotechnology | İngilizce | 3 |
| 2020-2021 | Basic Biotechnology | İngilizce | 3 |
| 2019-2020 | Basic Biotechnology | İngilizce | 3 |
| 2011-2012 | Plant Biotechnology | İngilizce | 3 |
| 2010-2011 | Plant Biotechnology | İngilizce | 3 |
Yönetilen Tezler
| Yıl | Hazırlayan Ad Soyad | Tez Adı | Üniversite |
|---|---|---|---|
| 2011 | DİDEM | Barley xyloglucan endotransglycosylase (XTH) expression patterns | YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ |
| 2015 | NURGÜL | Assessment of toxicity of various carbon and boron nanotubes on wheat and barley germination | YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ |
| 2016 | DİLARA | Substrate characterization of putative ancestral xyloglucan endotransglycosylase/hydrolases | YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ |
| 2017 | TUĞÇE | Analysis of xyloglucan endotransglycosylase/hydrolases enzymes to seek their evolutionary origins | YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ |
| 2019 | EZGİ | A study of abiotic stress protecting xyloglucan endotransglycosylase (XTH) genes in plants | YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ |
| 2022 | SELİN | Cloning, expression, and in silico analyses of selected xth enzymes from different plant species | YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ |
| 2020 | AYCHA | Production of Xyloglucan from Monocot Species Using Suspension Culture | YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ |
| 2022 | VEDAT CENK | In silico analyses of gene families involved in xyloglucan synthesis in barley (Hordeum vulgare L.) | YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ |
| 2024 | BUĞRA | Expression patterns of the expansin gene family in barley under drought stress | YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ |
| 2024 | AYCHA | Xyloglucan endotransglycosylases/hydrolases (XTH) genefamily in tomato (Solanum lycopersicum) | YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ |
| Yıl | Hazırlayan Ad Soyad | Tez Adı | Üniversite |
|---|---|---|---|
| 2017 | MERVE | Characterization of xyloglucan endotransglycosylase (XET) enzymes from different plant species | YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ |
| 2018 | BURCU | Multi-omics approach to investigate the roles of xyloglucan endotransglycosylase/hydrolases (XTHs) in agriculturally important plants | YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ |
| 2022 | MEHTAP | Investigation of the effects of long non-coding RNAs under drought stress on tomato (Solanum lycopersicum) | YEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ |